V nádržiach preplnených rybkami nestačí vodu iba prevzdušňovať, pretože dostatok kyslíku vo vode ešte nerieši jej znečistenie. Voda obsahuje rôzne mechanické nečistoty, škodlivé produkty látkovej výmeny, hnilobné produkty atď. Čistou, priezračnou vodou nesledujeme len efekt estetický, ale predovšetkým sa snažíme rybám a rastlinám poskytnúť prirodzené prírodné podmienky. Používanie filtrov v akvaristike má teda predovšetkým dvojakú úlohu: čistí vodu po mechanickej stránke a má vplyv na chemickobiologické parametre vody. Na druhej strane však nie je pravidlom, že použitie filtra je vždy nutné. Ak chováme v dostatočne veľkom akváriu primeraný počet rýb, a máme dostatočné množstvo rastlín, je biologická rovnováha v akváriu zachovaná. Msíme si však uvedomiť, že tam, kde filtrujeme, nie je spravidla už nutné vzduchovať, pretože filter zároveň aj okysličuje. Toto však platí len vtedy, ak nie je v nádrži prerybnené a filter pracuje správne. Pri zanesení filtra alebo pri veľkej spotrebe kyslíka v akváriu musíme inštalovať klasické vzduchovanie. Podľa spôsobu inštalácie rozdeľujeme filtre do troch hlavných skupín: vonkajšie filtre, vnútorné ponorné filtre a vnútorné pôdne filtre.